首先需要注意一些故障的分析和排除。比如如果在使用FFU风机过滤单元设备的时候，发现气流的速度过低，那么可以通过计算机调大FFU的转速百分比，这样便可以增大风机叶轮的输出风量。另外可以通过检查电源是否是正常电压、电流和频率。如果检查过后气流速度仍然很低，那么就需要更换过滤器了。
如果在使用FFU风机过滤单元设备的过程中，发现气流的速度过高，那么可以通过计算机调小FFU的转速百分比，减小风机叶轮的输出风量。如果气流为非层流或者杂质过多，那么就需要先确保气流通道上游没有大型的障碍物阻塞气流。还可以查看同一个清洁室或者是附近有没有其他的气流设备影响气流的正常流动。
其次还需要注意FFU风机过滤单元设备的维修和保养。FFU厂家建议大家一般来说每两个月使用尘埃粒子计数器测定FFU设备净化的洁净区域的洁净度。如果实际的洁净度低于要求的洁净度，那么就应该检查一下过滤器是否已经失效，是否需要更换。
如果是更换新的过滤器，FFU厂家提醒用户应当在停机的状态下进行。更换时需要特别注意搬运、拆箱、拿取等过程，避免在拆装时让过滤器产生损坏，安装过程中禁止用手触摸滤纸。在安装前，还需要将过滤器对着光亮处，肉眼区分过滤器是否有因为运输等原因存在漏洞的情况。
在进行更换的时候，断开FFU风机过滤单元设备的电源，移开箱体便可以取下失效的高效过滤器，更换上新的过滤器，使得贴在上面的箭头方向是指向地面的。
更换完高效过滤器以后，FFU厂家认为应该使用尘埃粒子计数器进行检漏测试，尤其是在过滤器的四周，要进行扫描查看是否有泄漏，如果发现了泄露的现象要使用密封胶进行密封，这样可以确保FFU风机过滤单元设备具有更高的使用效果
